Результаты и их обсуждение
В результате проделанной работы была построена модель структуры комплекса S15-16SрРНК (S15 T3C мутант).
Модель была уточнена до R-фактора 24,5% и Rfree 30,9% при разрешении до 2,9Е, и включает 86 аминокислотных остатков и 57 нуклеотидов. Общее число атомов модели в независимой части элементарной ячейки составило 1943. Модель обладает хорошими стехиометрическими параметрами и не содержит остатков, расположенных в запрещенных областях карты Рамачандрана.
Таблица 2.2.1. Статистика уточнения структуры комплекса комплекса S15-16SрРНК (S15 T3C мутант)
Пространственная группа |
Р6422 |
Параметры ячейки (Е) |
a=128.228, b= 128.2286, c=64.9505 |
Длина волны (Е) |
0,933 |
Разрешение (Е) |
500 - 2,9 |
Избыточность |
5,9 |
Полнота набора (%) |
98,0 |
Rsym (%) |
3,1 |
Rcryst/Rfree (%) |
24,5/30,9 |
Разрешение (Е) |
6,0 – 2,9 |
Число рефлексов |
8209 |
Вср (Е |
44,8 |
R.m.s.d. связей (Е) |
0,006 |
R.m.s.d. углов (°) |
1,2 |
Как видно из рисунка 2.2.1., белок S15 относится к семейству a-спиральных белков и состоит из четырёх a-спиралей, взаимодействующих с 16SрРНК и стабилизирующих данную структуру.
Фрагмент 16S рРНК из T.thermophilus (рис. 2.2.2.) длиной 57 нт состоит из укороченных спиралей Н20, Н21 и Н22. Спираль Н22 стыкуется со спиралью Н21, образуя вытянутую структуру, а спираль Н20 прилегает к ней под углом примерно в 60°.
Белок S15 распознаёт на поверхности РНК два удалённых участка, один из которых располагается в верхней части спирали H22, а другой – в районе соединения трёх спиралей РНК (рис. 2.2.3.). Участки отстают друг от друга на один виток спирали.
Возникновение и эволюция жизни. Концепция происхождения жизни
Эволюция жизни предполагает ее истоки, начало. Проблема происхождения жизни является одной из важнейших не только в биологии, но и во всем естествознании и имеет важное мировоззренческое значение.
В настоящее время существует несколько теорий происхождения жизни:
1. Концепция сверхъестественного (божественного) происхождения живого кр ...
Дыхание. Определение. Уравнение. Значение дыхания в жизни растительного
организма. Специфика дыхания у растений
Клеточное дыхание — это окислительный, с участием кислорода распад органических питательных веществ, сопровождающийся образованием химически активных метаболитов и освобождением энергии, которые используются клетками для процессов жизнедеятельности.
Суммарное уравнение процесса дыхания:
С6Н12О6 + 602 ► 6С02 + 6Н20 + 2875 кДж/мол ...
Систематика
ЦарствоЖивотные
Тип Хордовые
ПодтипЧерепные
Класс Млекопитающие
Отряд Приматы
Подотряд Антропоиды
Секция Узконосые обезьяны
НадсемействоГоминоиды
Семейство Гоминиды
Род Человек
Вид Разумный
Подвид Существующий
Homo sapiens sapiens ...