Результаты и их обсуждение
В результате проделанной работы была построена модель структуры комплекса S15-16SрРНК (S15 T3C мутант).
Модель была уточнена до R-фактора 24,5% и Rfree 30,9% при разрешении до 2,9Е, и включает 86 аминокислотных остатков и 57 нуклеотидов. Общее число атомов модели в независимой части элементарной ячейки составило 1943. Модель обладает хорошими стехиометрическими параметрами и не содержит остатков, расположенных в запрещенных областях карты Рамачандрана.
Таблица 2.2.1. Статистика уточнения структуры комплекса комплекса S15-16SрРНК (S15 T3C мутант)
|
Пространственная группа |
Р6422 |
|
Параметры ячейки (Е) |
a=128.228, b= 128.2286, c=64.9505 |
|
Длина волны (Е) |
0,933 |
|
Разрешение (Е) |
500 - 2,9 |
|
Избыточность |
5,9 |
|
Полнота набора (%) |
98,0 |
|
Rsym (%) |
3,1 |
|
Rcryst/Rfree (%) |
24,5/30,9 |
|
Разрешение (Е) |
6,0 – 2,9 |
|
Число рефлексов |
8209 |
|
Вср (Е |
44,8 |
|
R.m.s.d. связей (Е) |
0,006 |
|
R.m.s.d. углов (°) |
1,2 |
) Как видно из рисунка 2.2.1., белок S15 относится к семейству a-спиральных белков и состоит из четырёх a-спиралей, взаимодействующих с 16SрРНК и стабилизирующих данную структуру.
Фрагмент 16S рРНК из T.thermophilus (рис. 2.2.2.) длиной 57 нт состоит из укороченных спиралей Н20, Н21 и Н22. Спираль Н22 стыкуется со спиралью Н21, образуя вытянутую структуру, а спираль Н20 прилегает к ней под углом примерно в 60°.
Белок S15 распознаёт на поверхности РНК два удалённых участка, один из которых располагается в верхней части спирали H22, а другой – в районе соединения трёх спиралей РНК (рис. 2.2.3.). Участки отстают друг от друга на один виток спирали.
Бактериологические лаборатории
В системе Министерства здравоохранения и Государственного комитета санитарно-эпидемиологического надзора РФ наиболее разветвлена сеть бактериологических лабораторий. В соответствии с выполняемыми задачами выделяют:
• бактериологические лаборатории в составе ЛПУ;
• бактериологические лаборатории в составе комитетов Госсанэпиднадзора; ...
Понятие
симметрии
Симметрия представляет такую особенность природы, про которую принято говорить, что она фундаментальна, охватывает все формы движения и организации материи. Истоки понятия симметрии уходят в глубокую древность. В.И. Вернадский писал: " .представление о симметрии слагалось в течение десятков, сотен, тысяч поколений. Правильность его ...
Условия существования жизни, связи и функции живого
вещества
Условия существования живого вещества.
Жизнь, ее происхождение и развитие всегда, с древнейших времен волновали мысль человека.
Каковы же условия этой внешней среды обитания, благоприятствующие возникновению, сохранению и развитию жизни?
Экология рассматривает пять таких условий, совокупность которых определяет эти возможности (Мамед ...