Постановка ПЦР в микрообъеме с отрицательными контролями
ПЦР ставили по протоколам с использованием SYBRgreen и TaqMan. Общий объем ПЦР смеси составлял 1 мкл. Количество внесенной матрицы одинаково – 7 нг. Контролем служили пробы без матрицы. Измерение и регистрацию флуоресцентного сигнала проводили с помощью описанной системы детекции и программы «Qwantа». Результаты измерений представлены в таблице 5.
По данным таблицы видно, что приращение сигнала флуоресценции сопоставимо с измерениями, полученными при проведении ПЦР в капле смеси объемом 1 мкл в среде масла в обоих случаях. А значит амплификация проходит с не меньшей эффективностью чем на моделях с каплями. Сильный разброс значений в случае SYBRgreen лишний раз доказывает, что работа с микрообъемами – это очень сложный процесс, где даже самые минимальные погрешности в работе (погрешности пипеток, чистота преперата и т.д.) становятся критичными и влияют на результат.
Таблица 5.
|
SYBRgreen | |||||||||
|
С матрицей (флуоресценция, у.е.) |
Среднее значение (среднее отклонение) |
Без матрицы (флуоресценция, у.е) |
Среднее значение (среднее отклонение) |
Приращение (флуоресценция, у.е) |
Среднее значение(среднее отклонение) | ||||
|
41 |
40,8(3) |
34 |
35,4(4) |
7 |
5,4(3,5) | ||||
|
40 |
31 |
9 | |||||||
|
38 |
36 |
2 | |||||||
|
44 |
39 |
5 | |||||||
|
41 |
37 |
4 | |||||||
|
TaqMan | |||||||||
|
С матрицей (флуоресценция, у.е) |
Среднее значение (среднее отклонение) |
Без матрицы (флуоресценция,у.е) |
Среднее значение (среднее отклонение) |
Приращение (флуоресценция,у.е) |
Среднее значение(среднее отклонение) | ||||
|
82 |
89,2(8,5) |
57 |
58,2(1,5) |
25 |
31(19) | ||||
|
99 |
55 |
44 | |||||||
|
91 |
60 |
31 | |||||||
|
89 |
60 |
29 | |||||||
|
85 |
59 |
26 | |||||||
Выпирание
Повреждение и гибель растений от выпирания определяются разрывами корневой системы. Выпирание растений наблюдается, если осенью морозы наступают при отсутствии снежного покрова или если в поверхностном слое почвы мало воды (при осенней засухе), а также при оттепелях, если снеговая вода успеет всосаться в почву. В этих случаях замерзание ...
Для чего нам вкус и как его тренировать
Сигнал от вкусовых рецепторов используется организмом двояко. Во-первых, бессознательно - например, для управления желудочной секрецией, причем как ее количеством, так и составом, то есть вкус еды - это не только сигнал, что пора переваривать пищу, но и заказ на состав желудочного сока. Во-вторых, вкус используется осознанно - для получ ...
Система детекции результатов анализа
После амплификации регистрацию флуоресцентного сигнала проводили на экспериментальной установке, собранной на базе бинокулярного микроскопа МБС-11 (Россия ) c телевизионным адаптором TV-A и камерой фирмы «Wateс» (Japan) WAT-120 N. Сигнал с камеры подавался на плату видеозахвата «PixelView CX 881 P», находящийся на шине IDE персонального ...