Проведение ПЦР реакции в пластиковых микропланшетах
ПЦР проводили по вышеописанному протоколу (используя кит) на планшете с 25 лунками. ПЦР смесь добавляли в лунки объемом 1 мкл. Использовалось 2 вида контрольных проб. Первый контроль – это пцр смесь без матрицы. Второй контроль – это водный раствор SYBRgreen той же концентрации что и в пцр смеси. Схема эксперимента представлена на рис. 19. Измерение и регистрацию флуоресцентного сигнала проводили с помощью описанной системы детекции и программы «Qwantа».
Рис. 19.
Схема нанесения проб в лунки планшета.
Рис. 20.
Результат амплификации в пластиковых микропланшетах.
По результатам эксперимента (рис. 20) видно что в 1 и 3 ряду амплификация прошла, так как интенсивность флуоресценции заметно возросла. Темное пятнышко по центру лунок – это некоторый объем воздуха который образуется при покрытии плашки пленкой. Это указывает на то, что практически весь объем лунки заполнен образцом.
В этих же рядах в лунках под номером 5 сигнал значения не изменил. Это доказывает то, что матрица здесь не присутствовала. Контроль номер 2 также сработал, так как флуоресценция в 4 ряду свое значение не изменила. Второй и пятый ряды практически не флуоресцируют. Это подтверждает наличие в их лунках воды. Значения сигнала флуоресценции каждой лунки представлены в таблице 4. Графическое изображение полученной картины представлено на рис. 21.
|
1 столбец |
2 столбец |
3 столбец |
4 столбец |
5 столбец | |
|
1 ряд |
49,82 |
73,54 |
84,25 |
83,68 |
38,91 |
|
2 ряд |
17,61 |
35,76 |
34,41 |
31,66 |
24,56 |
|
3 ряд |
72,26 |
92,30 |
117,95 |
113,88 |
41,02 |
|
4 ряд |
26,88 |
34,04 |
40,36 |
43,36 |
40,88 |
|
5 ряд |
10,34 |
12,81 |
17,81 |
20,89 |
19,08 |
Таблица 4
Рис. 21.
Диаграмма, отображающая уровень сигнала в лунках пластиковой микроплашки.
ЧИП-методика
Более простая часть задачи получения гена, когда в нашем распоряжении имеется нужная индивидуальная иРНК. Но как ее получить, если мы располагаем только некоторым количеством клеток животного происхождения, в которых синтезировался интересующий нас белок, и, следовательно, имеется соответствующая ему иРНК?
Очевидно начать надо с того, ...
Метод
определения величины ВЕ в капиллярной крови пловцов
Избыток и дефицит буферных в крови оснований определяли с помощью измеренных параметров с использованием следующего уравнения:
BE= (1-0.014ctHb)*((1.43ctHb+7.7)*(pH-7.4)-24.8+cHCO3-)) [3,16,26,34] ...
Окрашивание препарата по способу Грама
1. Метил-виолет 30 сек.
2. Краску слить самотеком.
3. Высушить мазок фильтровальной бумагой.
4. Налить на 30сек. раствор люголя.
5. Слить самотеком раствор люголя.
6. Обесцвечивать спиртом 15 сек.
7. Промыть препарат водой.
8. Дополнительная окраска - разведенный фуксин 1 мин.
9. Промыть препарат водой, высушить фильтровальной б ...